Полногеномное сканирование с анализом ассоциации генов. На рисунке приведены данные о генотипировании 520460 «снипов» (однонуклеотидных замен), раскрашенные по хромосоме, в какой они расположены. Ордината каждой точки соответствует отрицательному логарифму вероятности того, что отличие последовательности ДНК в этом снипе меж группой больных и здоровых — случайное. Проще говоря, чем «выше» находится точка, тем больше шанс того, что соответствующая замена связана с развитием заболевания. Пунктирная линия показывает порог, «выше» которого отличия считались необходимыми (P<5&規10&��8). Надписи обозначают наименования генов, к которым относятся такие замены:
RERE — ген повторяющегося дипептида аргинин/глутамат (RE), участвующего в генетической регуляции и в некоторых случаях запускающего апоптоз («запрограммированную» погибель клетки);
PTPN22 — ген лимфоидной тирозинфосфатазы, мутации в каком могут вызывать диабет первого типа, ревматоидный артрит, волчанку, диффузный токсический зоб;
HLA-A / HLA-DRB1 — гены белков головного комплекса гистосовместимости подтипов I и II, расположенные в 6-ой хромосоме. Эти белки отвечают за массу иммунных функций, а конкретно — за презентирование антигенов Т-лимфоцитам;
IL2RA — ген &豩-цепи детектора интерлейкина 2. Этот белок уничтожается трипаносомой при заболевания Шагаса, что вызывает хроническое ингибирование иммунитета;
TYR — ген тирозиназы, отвечающей за синтез меланина. Мутация в этом гене также может привести к альбинизму.
Что интересно, подавляющее большая часть генов, «уличённых» в связи с витилиго, уже увидены во отношениях с другими аутоиммунными заболеваниями (см. рисунок), и только ген тирозиназы (TYR), непосредственно участвующей в синтезе меланина, не имеет никакого дела к иммунной системе. Мутантная форма тирозиназы (R402&��Q402) практически перестаёт делать пигмент (что и приводит к появлению белых пятен), а заодно такой её вариант становится иммуногенным для собственного организма, — непосредственно мутантая тирозиназа является основным аутоантигеном при витилиго (и это «добивает» меланоциты). Но оказывается, что нет худа без добра: аллельная форма тирозиназы, соответственная для витилиго, оказалась исключающей по отношению к другому аллельному варианту, вызывающему меланому! (Другими словами — увеличивающийся риск витилиго, связанный с этой заменой, «автоматически» понижает возможность возникновения опухоли.)
2-ое исследование позволило добавить к уже найденным ещё пару «иммунных» генов, также связанную с развитием витилиго [7]. Ген FOXP1 кодирует транскрипционный фактор, играющий решающую роль в развитии B- и T-лимфоцитов, также моноцитов. Ген CCR6 кодирует мембранный хемокиновый детектор 6, распознающий воспалительный медиатор (хемокин) CCL20, выделяемый макрофагами.
Как видно из всего этого «винегрета», объяснить развитие заболевания каким-то одним фактором, по-видимому, принципиально нереально. Кстати, по оценкам исследователей, найденные ими мутации позволяют объяснить наименее 10% «генетического риска» возникновения заболевания. Развитие витилиго может начаться с разных «концов», но, с другой стороны, в предстоящем это позволит использовать различные типы исцеления и терапии, дополняющие друг друга.
«Витилиго — сложное и многофакторное болезнь, включающее не только генетику, ну и многочисленные предпосылки среды», — говорит Маргарет «Пегги» Уоллес (Margaret Wallace), доктор молекулярной генетики и микробиологии, член Института генетики и Центра эпигенетики во Флоридском институте и одна из ведущих создателей работы. — «Видимо, и для терапии существует неограниченное количество возможностей. Отлично изучив все „тропинки“, по которым может продвигаться витилиго, мы, в конце концов, научимся пресекать путь заболевания. Не считая того, очевидно, что это — неплохой вариант для персонализованной медицины будущего, когда исцеление можно будет подбирать с учётом личных генетических особенностей каждого пациента» [8].
Сначало статья расположена в журнале «Косметика & Медицина» [9].
Литература
1. биомолекула: «Геном человека: как это было и как это будет»;
2. биомолекула: «В полку генов убыло»;
3. биомолекула: «Геном человека: подходящая книга, или глянцевый журнал?»;
4. биомолекула: «„Мусорная“ ДНК управляет эволюцией млекопитающих?»;
5. биомолекула: «Геном Нобелевского лауреата Джеймса Уотсона скоро будет расшифрован»;
6. Jin Y., Birlea S.A., Fain P.R., Gowan K., Riccardi S.L., Holland P.J., Mailloux C.M., Sufit A.J., Hutton S.M., Amadi-Myers A., Bennett D.C., Wallace M.R., McCormack W.T., Kemp E.H., Gawkrodger D.J., Weetman A.P., Picardo M., Leone G., Ta&覧eb A., Jouary T., Ezzedine K., van Geel N., Lambert J., Overbeck A., Spritz R.A. (2010). Variant of TYR and autoimmunity susceptibility loci in generalized vitiligo. N. Engl. J. Med. 362, 1686–1697;
7. Jin Y., Birlea S.A., Fain P.R., Mailloux C.M., Riccardi S.L., Gowan K., Holland P.J., Bennett D.C., Wallace M.R., McCormack W.T., Kemp E.H., Gawkrodger D.J., Weetman A.P., Picardo M., Leone G., Ta&覧eb A., Jouary T., Ezzedine K., van Geel N., Lambert J., Overbeck A., Spritz R.A. (2010). Common variants in FOXP1 are associated with generalized vitiligo. Nat Genet. 42, 576–578;
8. ScienceDaily — «Scientists Begin to Unravel Causes of Mysterious Skin Disease»;
9. Чугунов А. О. Генетические тропинки «загадочной заболевания кожи» — витилиго. Косметика & медицина 3 (2010), 24–27
Чугунов Антон
Загадочная генетика «загадочной заболевания кожи» — витилиго
Полногеномное сканирование с анализом ассоциации генов. На рисунке приведены данные о генотипировании 520460 «снипов» (однонуклеотидных замен), раскрашенные по хромосоме, в какой они расположены. Ордината каждой точки соответствует отрицательному логарифму вероятности того, что отличие последовательности ДНК в этом снипе меж группой больных и здоровых — случайное. Проще говоря, чем «выше» находится точка, тем больше шанс того, что соответствующая замена связана с развитием заболевания. Пунктирная линия показывает порог, «выше» которого отличия считались необходимыми (P<5&規10&��8). Надписи обозначают наименования генов, к которым относятся такие замены:
RERE — ген повторяющегося дипептида аргинин/глутамат (RE), участвующего в генетической регуляции и в некоторых случаях запускающего апоптоз («запрограммированную» погибель клетки);
PTPN22 — ген лимфоидной тирозинфосфатазы, мутации в каком могут вызывать диабет первого типа, ревматоидный артрит, волчанку, диффузный токсический зоб;
HLA-A / HLA-DRB1 — гены белков головного комплекса гистосовместимости подтипов I и II, расположенные в 6-ой хромосоме. Эти белки отвечают за массу иммунных функций, а конкретно — за презентирование антигенов Т-лимфоцитам;
IL2RA — ген &豩-цепи детектора интерлейкина 2. Этот белок уничтожается трипаносомой при заболевания Шагаса, что вызывает хроническое ингибирование иммунитета;
TYR — ген тирозиназы, отвечающей за синтез меланина. Мутация в этом гене также может привести к альбинизму.
Что интересно, подавляющее большая часть генов, «уличённых» в связи с витилиго, уже увидены во отношениях с другими аутоиммунными заболеваниями (см. рисунок), и только ген тирозиназы (TYR), непосредственно участвующей в синтезе меланина, не имеет никакого дела к иммунной системе. Мутантная форма тирозиназы (R402&��Q402) практически перестаёт делать пигмент (что и приводит к появлению белых пятен), а заодно такой её вариант становится иммуногенным для собственного организма, — непосредственно мутантая тирозиназа является основным аутоантигеном при витилиго (и это «добивает» меланоциты). Но оказывается, что нет худа без добра: аллельная форма тирозиназы, соответственная для витилиго, оказалась исключающей по отношению к другому аллельному варианту, вызывающему меланому! (Другими словами — увеличивающийся риск витилиго, связанный с этой заменой, «автоматически» понижает возможность возникновения опухоли.)
2-ое исследование позволило добавить к уже найденным ещё пару «иммунных» генов, также связанную с развитием витилиго [7]. Ген FOXP1 кодирует транскрипционный фактор, играющий решающую роль в развитии B- и T-лимфоцитов, также моноцитов. Ген CCR6 кодирует мембранный хемокиновый детектор 6, распознающий воспалительный медиатор (хемокин) CCL20, выделяемый макрофагами.
Как видно из всего этого «винегрета», объяснить развитие заболевания каким-то одним фактором, по-видимому, принципиально нереально. Кстати, по оценкам исследователей, найденные ими мутации позволяют объяснить наименее 10% «генетического риска» возникновения заболевания. Развитие витилиго может начаться с разных «концов», но, с другой стороны, в предстоящем это позволит использовать различные типы исцеления и терапии, дополняющие друг друга.
«Витилиго — сложное и многофакторное болезнь, включающее не только генетику, ну и многочисленные предпосылки среды», — говорит Маргарет «Пегги» Уоллес (Margaret Wallace), доктор молекулярной генетики и микробиологии, член Института генетики и Центра эпигенетики во Флоридском институте и одна из ведущих создателей работы. — «Видимо, и для терапии существует неограниченное количество возможностей. Отлично изучив все „тропинки“, по которым может продвигаться витилиго, мы, в конце концов, научимся пресекать путь заболевания. Не считая того, очевидно, что это — неплохой вариант для персонализованной медицины будущего, когда исцеление можно будет подбирать с учётом личных генетических особенностей каждого пациента» [8].
Сначало статья расположена в журнале «Косметика & Медицина» [9].
Литература
1. биомолекула: «Геном человека: как это было и как это будет»;
2. биомолекула: «В полку генов убыло»;
3. биомолекула: «Геном человека: подходящая книга, или глянцевый журнал?»;
4. биомолекула: «„Мусорная“ ДНК управляет эволюцией млекопитающих?»;
5. биомолекула: «Геном Нобелевского лауреата Джеймса Уотсона скоро будет расшифрован»;
6. Jin Y., Birlea S.A., Fain P.R., Gowan K., Riccardi S.L., Holland P.J., Mailloux C.M., Sufit A.J., Hutton S.M., Amadi-Myers A., Bennett D.C., Wallace M.R., McCormack W.T., Kemp E.H., Gawkrodger D.J., Weetman A.P., Picardo M., Leone G., Ta&覧eb A., Jouary T., Ezzedine K., van Geel N., Lambert J., Overbeck A., Spritz R.A. (2010). Variant of TYR and autoimmunity susceptibility loci in generalized vitiligo. N. Engl. J. Med. 362, 1686–1697;
7. Jin Y., Birlea S.A., Fain P.R., Mailloux C.M., Riccardi S.L., Gowan K., Holland P.J., Bennett D.C., Wallace M.R., McCormack W.T., Kemp E.H., Gawkrodger D.J., Weetman A.P., Picardo M., Leone G., Ta&覧eb A., Jouary T., Ezzedine K., van Geel N., Lambert J., Overbeck A., Spritz R.A. (2010). Common variants in FOXP1 are associated with generalized vitiligo. Nat Genet. 42, 576–578;
8. ScienceDaily — «Scientists Begin to Unravel Causes of Mysterious Skin Disease»;
9. Чугунов А. О. Генетические тропинки «загадочной заболевания кожи» — витилиго. Косметика & медицина 3 (2010), 24–27
Чугунов Антон
Оставить комментарий


